《忍者杀手》构建了一个近未来赛博朋克都市“新埼玉”,其核心设定是“忍者灵魂”的转生与厮杀——现代忍者并非职业,而是被古代忍者之魂附体的宿主,遵循着“忍杀”的绝对法则:忍者相遇必决生死。这一世界观将传统忍者文化暴力嫁接于高科技社会,形成独特的生存逻辑:主角藤木户浩介在妻儿被忍者杀害后,自身也被“忍者杀手”之魂寄生,从此被迫卷入无尽的忍杀轮回。生存的唯一途径是比对手更快、更残酷地完成“忍杀”,任何仁慈或迟疑都会导致瞬间死亡,世界规则化为最原始的丛林法则,唯有在血腥仪式中不断吞噬他人灵魂才能短暂延续自我存在。